COVID y más allá: los laboratorios se unen para impulsar la vigilancia genómica a nivel mundial / COVID and beyond: labs unite to boost genomic surveillance globally
Por Jennifer Rigby – CAMBRIDGE, Inglaterra, 25 de enero (Reuters) – Dos laboratorios en Gran Bretaña y Sudáfrica, que estuvieron a la vanguardia del seguimiento de las nuevas variantes del coronavirus durante la pandemia, se han unido para mantener el enfoque en la vigilancia genómica a nivel mundial a medida que retrocede la emergencia de COVID.
Los equipos dijeron que les preocupaba que los gobiernos y los financiadores pudieran retirarse de dicha vigilancia, a pesar de su potencial para monitorear mejor muchas enfermedades infecciosas, desde la malaria hasta el cólera.
“Uno de los grandes beneficios que surgió de la pandemia fue esta enorme inversión global en infraestructura”, dijo John Sillitoe, director de la Unidad de Vigilancia Genómica (GSU) del Instituto Wellcome Sanger de Cambridge, uno de los dos socios.
En la vigilancia genómica, los científicos primero obtienen datos sobre el material genético de un virus u organismo en un proceso llamado secuenciación. Luego analizan los datos de varias muestras para buscar similitudes y diferencias entre ellas, por ejemplo, para rastrear cómo el virus está cambiando o propagándose.
El proceso ha existido durante décadas, pero salió a primer plano a medida que los científicos y los equipos de salud pública rastrearon el rápido cambio del coronavirus.
Pero Sillitoe dijo que temía que los activos necesarios para el proceso, como las máquinas de secuenciación compradas en la pandemia, ahora estuvieran “inactivos” en algunos países, lo que sería una oportunidad perdida.
“Tenemos muchos puntos ciegos, tanto en patógenos como en regiones”, dijo Tulio de Oliveira, director del Centro de Respuesta a Epidemias e Innovación de la Universidad de Stellenbosch, el otro laboratorio de la asociación. Durante el COVID, su equipo confirmó el descubrimiento de las variantes Beta y Omicron.
De Oliveira, que también se unirá a la GSU como subdirector, dijo que el potencial de otras enfermedades era enorme.
Por ejemplo, el trabajo de los dos laboratorios, así como de un consorcio global de enfermedades relacionadas con el clima, ha duplicado el número de secuencias disponibles para el dengue, el chikungunya y los mosquitos portadores de malaria en solo el último año, dijo.
Los laboratorios trabajarán juntos para compartir recursos, así como para apoyar a los socios en la vigilancia de enfermedades a nivel mundial con experiencia y materiales, junto con esfuerzos más amplios liderados por la Organización Mundial de la Salud, dijeron de Oliveira y Sillitoe.
Reportaje de Jennifer Rigby; Edición de Nick Macfie
COVID and beyond: labs unite to boost genomic surveillance globally
By Jennifer Rigby – CAMBRIDGE, England, Jan 25 (Reuters) – Two laboratories in Britain and South Africa, which were at the forefront of tracking new coronavirus variants during the pandemic, have teamed up to keep the focus on genomic surveillance globally as the COVID emergency recedes.
The teams said they were worried governments and funders may pull back from such surveillance, despite its potential to better monitor many infectious diseases, from malaria to cholera.
“One of the big benefits that came from the pandemic was this huge global investment in infrastructure,” said John Sillitoe, director of the Genomic Surveillance Unit (GSU) at the Wellcome Sanger Institute in Cambridge, one of the two partners.
In genomic surveillance, scientists first get data about the genetic material of a virus or organism in a process called sequencing. Then they analyse the data from several samples to look for similarities and differences between them, for example to track how the virus is changing or spreading.
The process has been around for decades, but came to the forefront as scientists and public health teams tracked the fast-changing coronavirus.
But Sillitoe said he feared assets needed for the process – like sequencing machines bought in the pandemic – were now “sitting idle” in some countries, which would be a missed opportunity.
“We have a lot of blind spots, both on pathogens and on regions,” said Tulio de Oliveira, director of the Centre for Epidemic Response and Innovation at Stellenbosch University, the other lab in the partnership.
During COVID, his team confirmed the discovery of the Beta and Omicron variants.
De Oliveira, who will also join the GSU as a deputy director, said the potential for other diseases was huge.
For example, work by the two labs, as well as a global climate-related disease consortium, has doubled the number of sequences available for dengue, chikungunya, and malaria-carrying mosquitoes in just the last year, he said.
The labs will work together to share resources as well as supporting partners in disease surveillance globally with expertise and materials, alongside wider World Health Organization-led efforts, de Oliveira and Sillitoe said.
Reporting by Jennifer Rigby; Editing by Nick Macfie
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